Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DUSP1P28562 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DUSP1P28562 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms