Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRKACBP22694 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms