Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNA1P20827 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms