Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATP4AP20648 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms