Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB5AP20339 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms