Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD53P19397 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD53P19397 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD53P19397 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD53P19397 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CD53P19397 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD53P19397 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD53P19397 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD53P19397 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD53P19397 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD53P19397 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms