Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGB4P16144 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGB4P16144 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms