Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME1P15531 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NME1P15531 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NME1P15531 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms