Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC192P0DO97 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC192P0DO97 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC192P0DO97 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC192P0DO97 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC192P0DO97 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC192P0DO97 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC192P0DO97 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC192P0DO97 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC192P0DO97 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC192P0DO97 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC192P0DO97 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC192P0DO97 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms