Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBP07199 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CENPBP07199 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms