Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EDN1P05305 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EDN1P05305 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EDN1P05305 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EDN1P05305 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EDN1P05305 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EDN1P05305 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EDN1P05305 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDN1P05305 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDN1P05305 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDN1P05305 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDN1P05305 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDN1P05305 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDN1P05305 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EDN1P05305 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms