Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRB1P04280 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRB1P04280 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRB1P04280 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRB1P04280 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PRB1P04280 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRB1P04280 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRB1P04280 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRB1P04280 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms