Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMUO75648 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms