Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
JRKO75564 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
JRKO75564 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
JRKO75564 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
JRKO75564 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JRKO75564 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JRKO75564 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JRKO75564 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JRKO75564 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JRKO75564 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JRKO75564 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JRKO75564 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JRKO75564 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
JRKO75564 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JRKO75564 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
JRKO75564 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms