Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCA5O60264 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMARCA5O60264 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms