Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP9BO43861 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms