Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EDIL3O43854 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms