Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGCEO43556 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGCEO43556 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGCEO43556 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCEO43556 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGCEO43556 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SGCEO43556 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SGCEO43556 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SGCEO43556 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SGCEO43556 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCEO43556 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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