Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HOXA3O43365 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HOXA3O43365 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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HOXA3O43365 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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