Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF208O43345 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF208O43345 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms