Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF1O43189 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF1O43189 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF1O43189 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF1O43189 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF1O43189 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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