Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ANKRD28O15084 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms