Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLGNO14967 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLGNO14967 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLGNO14967 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CLGNO14967 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLGNO14967 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms