Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC169A6NNP5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms