Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP5A6NIR3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP5A6NIR3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP5A6NIR3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP5A6NIR3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP5A6NIR3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP5A6NIR3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP5A6NIR3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP5A6NIR3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP5A6NIR3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP5A6NIR3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP5A6NIR3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP5A6NIR3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP5A6NIR3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP5A6NIR3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms