Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM221AA4D161 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms