Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TRBV2A0A0J9YWF9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRBV2A0A0J9YWF9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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