Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms