Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNPO3Q9Y5L0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNPO3Q9Y5L0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms