Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SUPT16HQ9Y5B9 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms