Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG4BQ9Y4P1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms