Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRAF6Q9Y4K3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRAF6Q9Y4K3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms