Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMC9Q9Y3B6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms