Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR1DQ9Y2S0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR1DQ9Y2S0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms