Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms