Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms