Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMCC3Q9ULS5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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