Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms