Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCHIP1Q9P0W5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms