Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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