Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MIS18AQ9NYP9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MIS18AQ9NYP9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms