Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM248Q9NWD8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms