Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASF1BQ9NVP2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms