Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEPPQ9NTK1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms