Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LHX9Q9NQ69 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms