Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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