Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLMQ9NP87 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms