Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM38AQ9H6F2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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