Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHLHE41Q9C0J9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms