Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM4Q9C037 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms